崇禎皇帝登基之后，為了解除后金對(duì)明的邊境壓力，任命袁崇煥為兵部尚書(shū)兼右副都御史，督師薊、遼，兼督登、萊、天津軍務(wù)。崇禎二年（公元1629年），皇太極親率大軍避開(kāi)袁崇煥的防區(qū)，直逼北京城下。袁崇煥得知消息后率部星夜馳援京師，迫使后金軍退回關(guān)外。金軍撤退后，剛愎自用的崇禎皇帝中了皇太極的反間計(jì)，反而將袁崇煥逮捕下獄。崇禎三年（公元1630年），袁崇煥被處死于西市。

　　《明史•袁崇煥傳》說(shuō)：“會(huì)我大清設(shè)間，謂崇煥密有成約，令所獲宦官知之，陰縱使去。其人奔告于帝，帝信之不疑�！蓖跸戎t《東華錄•天聰三年》說(shuō)得更為確切：明朝有兩個(gè)太監(jiān)被后金軍俘虜去以后，被關(guān)在金營(yíng)里。有天晚上，一個(gè)姓楊的太監(jiān)半夜醒來(lái)，聽(tīng)見(jiàn)兩個(gè)看守他們的金兵在外面輕聲地談話。一個(gè)金兵說(shuō)：“今天咱們臨陣退兵，完全是皇上(指皇太極)的意思，你可知道?”另一個(gè)說(shuō)：“你是怎么知道的?”一個(gè)又說(shuō)：“剛才我就看到皇上一個(gè)人騎著馬朝著明營(yíng)走，明營(yíng)里也有兩個(gè)人騎馬過(guò)來(lái)，跟皇上談了好半天話才回去。聽(tīng)說(shuō)那兩人就是袁將軍派來(lái)的，他已經(jīng)跟皇上有密約，眼看大事就要成功啦……”姓楊的太監(jiān)偷聽(tīng)了這番對(duì)話，趁看守他的金兵不注意，偷偷地逃了出來(lái)。他跑回皇宮，向崇禎帝報(bào)告，崇禎先是逮捕了袁崇煥，八個(gè)月之后以謀反罪處死了袁崇煥�；侍珮O的反間計(jì)漏洞百出，這八個(gè)月里如果崇禎皇帝仔細(xì)地查證，事情一定會(huì)大白于天下，但是袁崇煥還是被處死。這除了皇太極反間計(jì)得逞之外，還有更深的原因。

　　首先是袁崇煥失去了崇禎皇帝的信任。崇禎皇帝與歷史上的亡國(guó)之君比較起來(lái)，可以說(shuō)并不是那么昏庸，甚至“即位之初，沈機(jī)獨(dú)斷，刈除奸逆，天下想望治平”。無(wú)論是朝野大臣還是平民百姓，都對(duì)他寄予了很大的期望。但是，崇禎皇帝卻是一個(gè)多疑刻薄、剛愎自用的皇帝。崇禎皇帝即位的時(shí)候，大明王朝內(nèi)部被魏忠賢閹黨集團(tuán)搞得一團(tuán)混亂，派別林立，同時(shí)后金的軍事力量不斷騷擾明朝邊境，甚至能長(zhǎng)驅(qū)直下威脅北京。立志有所作為的崇禎帝不禁“臨朝浩嘆，慨然思得非常之材，而用匪其人，益以?xún)f事”。對(duì)那些他抱有很大期望的大臣，他先是授以大權(quán)，而如果他對(duì)這些大臣失望，便切齒憤恨，必殺之而后快。因此崇禎皇帝在位17年，所殺的大臣不計(jì)其數(shù)，其中總督有7人，巡撫有11人。內(nèi)閣重臣更頻繁替換，先后用了近五十人。

　　崇禎皇帝起初對(duì)袁崇煥是非常信任的。4月他即位后，7月他就召見(jiàn)袁崇煥，咨詢(xún)平定遼東的方略：“你不遠(yuǎn)萬(wàn)里應(yīng)召來(lái)京，忠心耿耿，義勇可佳。希望你把平定遼東的方略，詳詳細(xì)細(xì)地稟奏上來(lái)�！痹鐭ɑ卮鸬溃骸捌蕉ㄟ|東的方略已經(jīng)全部寫(xiě)進(jìn)了奏章。臣受到陛下的寵愛(ài)，感激涕零，我請(qǐng)求能夠得到皇上恩準(zhǔn)，我受命在外的時(shí)候，可以根據(jù)遼東情況斟酌處理平遼大事。如果能夠得到皇帝的恩準(zhǔn)，臣冒昧地認(rèn)為，我用五年時(shí)間就能夠全部恢復(fù)遼東疆域�！背绲澔实鄯浅M意袁崇煥的答復(fù)，對(duì)袁崇煥許諾說(shuō)：“如果你能夠恢復(fù)遼東故土，我不會(huì)吝惜封侯的獎(jiǎng)賞，你對(duì)朕盡心盡力，你的子孫也會(huì)因此受到獎(jiǎng)賞！”袁崇煥出關(guān)時(shí)領(lǐng)有480萬(wàn)遼餉，其中米180萬(wàn)石，另發(fā)內(nèi)帑120萬(wàn)、鎧甲40萬(wàn)具，紅夷大炮10門(mén)，其他弓箭軍械無(wú)數(shù)。到任后，他立即加強(qiáng)防守，準(zhǔn)備收復(fù)失地，安撫流亡平民。同時(shí)裁汰軍隊(duì)，試圖練出一支精兵，并將薊州精銳部隊(duì)充實(shí)到遼東防線。

　　實(shí)際上，此時(shí)的遼東邊境上后金在軍事力量上已經(jīng)占據(jù)了優(yōu)勢(shì)，袁崇煥的許諾僅僅是為了安慰年輕的皇帝，但是崇禎皇帝卻信以為真。崇禎二年（公元1629年）春，蒙古部族發(fā)生大饑荒，請(qǐng)求開(kāi)放邊境貿(mào)易，于是袁崇煥上奏要求開(kāi)放市場(chǎng)，試圖通過(guò)稅收來(lái)資助軍隊(duì)，從而減輕朝廷的軍餉負(fù)擔(dān)，但崇禎皇帝發(fā)布詔書(shū)斥責(zé)說(shuō)：“你與蒙古貿(mào)易，這不是明擺著拿物資資助賊寇嗎？這怎么能容許？”袁崇煥對(duì)此不以為然：“關(guān)外市場(chǎng)貿(mào)易，只允許用米布交換柴草，違禁物品，依法嚴(yán)禁，而且他們保證不與賊寇（后金）相通。他們都說(shuō)：‘家中空空如也，如果再不進(jìn)行邊境貿(mào)易，用什么來(lái)養(yǎng)家糊口呢？’他們?cè)敢庥闷拮幼鳛槿速|(zhì)，斷不敢誘導(dǎo)賊寇侵犯薊遼。”但在后來(lái)的后金軍隊(duì)對(duì)北京城的圍困中，為后金進(jìn)攻北京帶路的，恰恰就是這支袁崇煥在奏章中認(rèn)同“斷不敢誘奴入犯薊遼”的蒙古部族。因此，雖然袁崇煥力解北京之圍，崇禎皇帝也對(duì)袁崇煥進(jìn)行了獎(jiǎng)賞，但之前發(fā)生的毛文龍事件，加上這次后金軍隊(duì)的騷擾，使得崇禎皇帝內(nèi)心深處對(duì)袁崇煥已有所不滿。

　　毛文龍是明朝邊境的地方軍閥，他率部在皮島（今椴島）至長(zhǎng)山列島之間流動(dòng)抗擊后金，同時(shí)聯(lián)絡(luò)山東登州一線明軍協(xié)同作戰(zhàn)，遙相呼應(yīng)，構(gòu)成犄角之勢(shì)，一度遏制了后金軍的西進(jìn)和南下。盡管如此，毛文龍的部隊(duì)獨(dú)處海島，朝廷很難節(jié)制，毛文龍的部下官員也有貪污、冒認(rèn)軍餉的行徑。由于毛文龍不聽(tīng)調(diào)遣，崇禎二年（公元1629年）六月，袁崇煥以談餉閱兵為名，將毛文龍誘騙至旅順雙島的一處古廟中，將其拘捕，歷數(shù)其“冒餉飾功”、“不受節(jié)制”等12條罪狀，當(dāng)眾以尚方劍將其斬殺。毛文龍被殺后，后金軍隊(duì)所受牽制大大減少，崇禎皇帝聽(tīng)到毛文龍被殺的消息“意殊駭，念既死，且方倚崇煥，乃優(yōu)旨褒答。俄傳諭暴文龍罪，以安崇煥心”。但他對(duì)袁崇煥“優(yōu)旨褒答”，僅僅是在毛文龍被殺的既成事實(shí)無(wú)法改變的情況下的無(wú)奈之舉。

崇禎皇帝處死袁崇煥還有一個(gè)原因，那就是袁崇煥與后金的和議。努爾哈赤死后，袁崇煥未經(jīng)朝廷允許，私自派使者吊唁。后金皇太極趁機(jī)遣使回復(fù)，謀求議和。當(dāng)時(shí)，盡管明朝軍隊(duì)屢戰(zhàn)屢敗，但基于天朝尊嚴(yán)，“諸將罔敢議戰(zhàn)守”。雖然袁崇煥的和議戰(zhàn)略上完全正確，而且崇禎皇帝起初也同意，但這種與皇太極關(guān)于和議的私下書(shū)信往來(lái)，讓崇禎皇帝產(chǎn)生了懷疑。

　　崇禎二年（公元1629年）袁崇煥被逮捕入獄，囚禁審訊半年后，崇禎三年（公元1630年）八月，崇禎帝以“袁崇煥咐托不效，專(zhuān)恃欺隱，以市米則資盜，以謀疑則斬帥”等罪名將袁崇煥處死于西市。不明真相的京城百姓對(duì)袁崇煥恨之入骨，“劊子手割一塊肉，百姓付錢(qián)，取之生食。頃間肉已沽清。再開(kāi)膛出五臟，截寸而沽。百姓買(mǎi)得，和燒酒生吞，血流齒頰”。